Возглавит Комиссию вице-премьер-министр – министр инфраструктуры Борис Колесников.
 
Основными задачами Комиссии являются содействие обеспечению координации деятельности центральных и местных органов исполнительной власти, других учреждений и организаций, участвующих в выполнении Государственной программы авиационной безопасности гражданской авиации по вопросам защиты гражданской авиации от актов незаконного вмешательства, подготовка предложений относительно способов реализации государственной политики по вопросам авиационной безопасности, проведение оценки состояния обеспечения авиационной безопасности при проектировании новых и реконструкции действующих аэропортов.
 
Предложения и рекомендации Комиссии могут быть реализованы путем принятия Кабмином решения, проект которого вносит орган исполнительной власти в пределах своих полномочий.
 
Организационное, информационное, материально-техническое обеспечение деятельности Комиссии осуществляется Госавиаслужбой.